SZKOLENIA

Analiza danych RNA-seq w R

Opis kursu

Szkolenie przeznaczone jest dla osób, które już posiadają doświadczenie w programowaniu w R i chcą nauczyć się przeprowadzania analiz danych pochodzących z eksperymentu RNA-seq w R. Uczestnicy nabędą umiejętności praktyczne z zakresu samodzielnego przeprowadzania kolejnych etapów analizy danych wysokoprzepustowych (analiza jakości danych fastq, mapowanie do referencyjnego genomu, zliczanie odczytów, analiza różnicowa, analiza ścieżek GO). Dowiedzą się także, jak w R pisać raporty z analiz, aby zawrzeć wszystkie kolejne etapy wraz z poglądowymi wykresami. Podczas kursu, pod okiem prowadzącego, będzie można samodzielnie przeprowadzić analizę danych NGS na wybranym zestawie danych (tzw. case study).

Dla kogo?

Dla każdego, kto chciałby nabyć lub poszerzyć wiedzę i umiejętności z zakresu przeprowadzania analiz danych pochodzących z eksperymentu RNA-seq w R.

Program kursu

Analiza jakości sekwencjonowania

Mapowanie i zliczanie odczytów

Analiza różnicowa

Analiza GO i KEGG

Wizualizacja wyników

Case study

Pozostałe informacje

19-20 września

edycja listopad-grudzień

5 h/dzień

10 miejsc

1500 zł + 23% VAT